Danny Phantom, 14 yaşında, Casper Lisesi'ne giden ve popüler olmayan bir çocuğun hayatını ve maceralarını anlatmaktadır. Hayalet avcısı ebeveynleri ve ablasıyla beraber yaşamaktadır. En yakın arkadaşları Sam ve Tuck'ın isteği üzerine ailesinin hayalet portaline girer. Yanlışlıkla bir düğmeye basar ve DNAsını ektoplazma ile değiştiren bir şoka kapılır. Böylece hayalet çocuğa dönüşür. Danny -kendine Danny Phantom demektedir- hayalet halinde uçabilmekte, görünmez olabilmekte ve vücudunu maddelerden geçirebilmektedir. Sonralarda gücünü kontrol etmeyi öğrendikçe yeni güçler keşfeder.